在环境行政执法程序中，保护当事人的合法权益是非常重要的。以下是一些建议：
尊重法律程序：确保执法人员依法执法，遵循法定程序进行调查和处罚。当事人应当了解自己的权利和义务，在执法过程中积极合作，同时可以要求执法人员出示合法的执法证件。
提供有效沟通渠道：为当事人提供有效的沟通渠道，可以通过电话、邮件或面对面会议等方式与执法部门进行沟通。当事人可以提出自己的意见和申辩，解释自己的情况和观点。
保障听证权利：当事人有权利参加听证会，并进行辩护。在听证会上，当事人可以提供证据、质疑对方证据，并进行辩护，确保自己的合法权益得到保护。
提供申诉途径：如果当事人对执法结果不满意，可以通过申诉途径提出上诉，要求重新审理。在申诉过程中，当事人应当提供充分的证据和理由，维护自己的权益。
加强执法透明度：执法部门应当公开执法信息，包括执法依据、程序和结果等，保障执法的公正和透明性。当事人可以通过公开信息了解执法情况，确保自己的权益受到保护。
通过以上措施，可以有效保护当事人在环境行政执法程序中的合法权益，确保执法过程公正、透明和合法。